2004/2005年度   2004年建立化肥商業淡儲制度。2004年12月，政府對第一批605萬噸淡儲指標實施了公開招標，近40家企業中標。2005年2月，政府又對第二批 195萬噸淡儲指標實施了公開招標，共有8家企業中標。儲肥品種以尿素、磷銨等高濃度肥為主。

　　2005/2006年度   國家發改委、財政部通過招標方式，分兩批確定了42家承儲企業，淡儲規模為800萬噸。淡儲以尿素為主，占70%以上。各省也陸續實施省級化肥儲備制度，儲備規模超過300萬噸。

　　2006/2007年度   2006年10月份，國家發改委和財政部組織的2006/2007年度化肥淡儲工作正式啟動。淡儲總量仍為800萬噸，淡儲期限從2006年10月到 2007年的3月。淡儲仍以尿素為主，占70%以上，個別地區承儲企業可以根據當地用肥需求，并在報淡儲委托單位備案批準后，適當調低尿素所占比例，但不得低于淡儲化肥總量的50%。

　　2007/2008年度   2007/2008年度初次招標時，化肥淡儲總規模仍保持800萬噸，淡儲期限半年，總計27個淡儲區域。業績良好、有過淡儲經驗的企業在此次評標過程中優勢比較明顯。2008年1月，國家對2007/2008年度化肥淡季商業儲備新增200萬噸，這次新增的量在化肥品種上有所要求，要求磷酸二銨、磷復肥等品種應占一半以上。

　　2008/2009年度  第一次淡儲招標規模為1100萬噸，比上年度增加了300萬噸。其中，1000萬噸淡儲指標優先給予近兩年淡儲工作搞得較好的40余家化肥流通與生產企業，另100萬噸通過企業申請、專家評審的招標方式確定承儲企業。后來又增加磷肥專項淡儲100萬噸，總額達到1200萬噸，磷肥專項招標另行進行。后經國務院批準，在2009年1月份時，淡儲量增加400萬噸達到1600萬噸。

　　2009/2010年度   共有70多家企業參與化肥商業淡儲，加上磷肥專項淡儲100萬噸，本年度淡儲總量為1600萬噸，與上年持平，其中尿素800萬噸，另有幾家企業參與了鉀肥淡儲。

　　2010/2011年度   化肥淡儲總量1600萬噸，其中70萬噸磷肥專項單獨招標，其余的1530萬噸淡儲量共有72家企業中標。其中生產企業32家，生產企業和流通企業聯合中標12家，中標量占總量1/3左右。本次淡儲補貼時間增加了1個月，延長至7個月，中央財政增加補貼金1.5億元。

　　2011/2012年度   化肥淡儲總量仍維持1600萬噸不變，其中505萬噸需重新進行招標，其余自然延期。化肥淡儲補貼時間恢復至6個月，恢復到了正常狀態。鼓勵流通企業和生產企業組成聯合體共同承擔淡儲任務。2011年9月21日，國家發改委發布《2011/2012年化肥淡儲資格招標有關問題解釋》，這是首次對化肥淡儲招標問題進行專門解釋。