企業多、各企業產能低形成的當前化肥農藥行業分散的過剩，是當前對資源更大的浪費。其中不符合當前國家重點支持方向的企業，將會被淘汰出局。中國氮肥工業協會副理事長劉淑蘭近日表示，“十二五”化肥產業重要的工作就是結構調整。中國磷肥工業協會也提出，磷肥工業已經進入了一個新的發展和調整時期，部分品種已經出現了產能過剩，并還有新一輪投資過熱的可能，2010年將通過提高環保標準、能耗標準實現去產能化，鼓勵、扶持水平先進、“三廢”排放少、能耗低的技術和企業，淘汰落后產能。
《石油和化工產業振興支撐技術指導意見》明確提出，化肥領域的支撐技術主要集中在節能減排、提高化學礦利用率方面，農藥工業的重點在于推廣先進的清潔生產技術，主攻自主創制。
當前化肥農藥行業應重視解決的重要問題為：
一是產能趨于過剩，投資過熱現象值得注意。
自2005年以來，由于需求拉動，尿素等氮肥產品產能快速增加。五年間累計新增尿素產能1700多萬噸。2009年尿素總產能已達到6500萬噸，目前仍有在建和規劃建設的尿素產能約1000 萬噸。磷肥總產能約2000萬噸，產能過剩約五分之一以上，但一些地方仍有一批新項目在建。這種現象，需引起各地行業主管部門的高度重視。采取有力措施，控制盲目新增氮肥、磷肥生產能力應成為今后一段時間工作的重點。
二是產業集中度低，調整結構任務艱巨。
中國合成氨前十家企業產能集中度為 13.3%（發達國家約為80%）。中國合成氨生產企業有465家，平均產量11萬噸，其中8萬噸以下的有200家左右，甚至還有2萬～3萬噸污染大、得率低、能耗高的碳酸氫銨裝置在生產。中國有磷酸裝置的企業130多家，平均規模11萬噸；有生產許可證的復混肥企業4350家（準入門檻僅為2萬噸）。
總體上看，中國化肥行業小企業多、布局散、裝置落后、能耗高、污染重的特征比較明顯，結構調整的任務十分繁重。
三是鉀資源對外依存度較高。
中國是鉀肥消費量最大的國家，每年消費約800萬噸鉀肥（占世界鉀肥消費量的20%），目前約50%左右需進口。預計隨著2011年羅布泊年產170萬噸鉀鹽建設項目的投產，中國鉀肥自給率將會明顯提高。下一步應進一步加大青海柴達木鹽湖鉀礦資源的開發利用。
四是假劣農資案件時有發生，安全隱患不容忽視。
目前，一些地方仍出現假化肥、假農藥案件，以次充好、坑農害農現象時有發生。水果、蔬菜等農作物上也不時發現禁用高毒農藥殘留，違法、非法無證生產農藥的現象依然存在。最近發生的海南毒豇豆事件，也反映出有關部門需進一步加強對高毒農藥的使用輔導，做好農產品和食品的安全監督檢查。
2010年以來，隨著國際市場逐步回暖，加之國家農業增產政策的實施，有力促進了化肥、農藥的市場需求增加。預計全年尿素產量3220萬噸，增長9.7%（其中出口230萬噸）；磷肥產量 1550萬噸，增長4.75%；鉀肥產量約400萬噸，增長9.4%。預計2010年農藥總產量將達230萬～240萬噸，主要品種可滿足農業生產的需要。
