從國內生產能力看，除鉀肥尚需一定數量的進口外，氮肥、磷肥和農藥都完全能夠滿足需要，而且產能明顯過剩。2009年國內尿素產能6100萬噸，磷酸二銨產能1300萬噸，從當前需求來看，尿素和磷酸二銨產能分別過剩1000萬噸和600萬噸。2008年國內農藥產量達到 185萬噸以上，是世界第一大生產國和出口國，保證供給不是問題。因此，調整結構是當前化肥農藥產業的主要任務。
有研究報告顯示，2008年國內化肥產量氮肥占74%，磷肥占21%，鉀肥占5%。化肥施用結構方面，氮磷鉀肥施用比例在1∶0.33∶0.22，生產結構和施用結構嚴重不平衡，氮肥過剩而鉀肥供給嚴重不足。因此，化肥產品結構調整，應適當控制磷肥、氮肥產能，加強鉀肥資源勘探開發建設，合理有序增加鉀肥生產；化肥品種以適應作物所需營養元素規律的平衡要求，向專用化、緩效化、控效化方向發展，淘汰低濃度有污染的化肥。化肥企業結構調整，要通過并購重組，提高集中度，沒有資源的小化肥要逐步退出基礎肥生產。生產結構調整方面，化肥行業中將繼續推廣節能高效的潔凈煤氣化技術。加強中低品位磷礦選礦產業化開發，發展窯法磷酸，以降低能源消耗，減少磷石膏產出。
農藥結構調整，主要是繼續削減高毒、高殘留農藥品種，發展高效、低毒、低殘留、環境相容性好的品種。中國玉米類作物種植面積已經超越稻谷類躍居第一，除草劑使用量增加；蔬菜和水果種植面積不斷擴大，殺菌劑用量也將穩中有升。為此，應發展除草劑新品種、水果蔬菜用的新型殺菌劑、殺線蟲劑和病毒抑制劑等，增加水基化制劑、固體化制劑比重，減少對環境影響較大的乳油和可濕性粉劑。同時進行生產布局調整，組建大型農藥集團，農藥生產向專業園區集聚。
