中國化肥流通體系的發展大致經歷了完全計劃管理階段、計劃與市場管理相結合階段和市場配置資源三個歷史時期。完全計劃管理階段從1950年到80年代初期，經歷了約30年的時間，期間中國化肥流通體系的框架得到初步形成。從80年代初期到1998年，在計劃與市場管理相結合階段先后經歷了“雙軌制”和化肥專營體制兩個時段，化肥流通體系嘗試進行了各種突破。從1998年至今，在市場配置資源的階段，化肥流通體系實現了以市場化為基礎的飛躍并經歷了WTO過渡期的考驗，化肥流通體系正在逐步完善和發展。
政策是時代的產物，隨著化肥產業時代進程的發展，化肥的產業政策也在不斷調整。在完全計劃管理階段，最初是化肥分配政策主導化肥生產和流通體系，隨著化肥商品特征的顯現，價格政策走上歷史舞臺。在計劃與市場管理相結合階段，化肥分配政策轉向化肥專營政策，價格政策進一步加強，化肥運輸政策逐漸明晰。在市場資源配置階段，價格政策仍是政策焦點，稅收政策成為重要的杠桿，運輸政策、儲備政策和監管政策齊頭并進，針對入世的關稅配額政策也相繼出臺。總體上來看，中國化肥流通體系的發展是依賴于政策逐步建立起來的，體系自身的發展又對政策提出了很多要求，政策隨之而變，兩者相輔相成。隨著市場化進程的加快，中國化肥流通體系還會出現更多的問題，需要與時代相符合的政策加以解決。
