2010年農藥生產進入高成本階段。2010年第四季度，雖值農藥銷售淡季，但大宗常規農藥品種的報價都比2009年第四季度高出10%～20%，如草甘膦原藥為24500元（噸價，下同）、高效氯氟氰菊酯原藥為170000～175000元、氯氰菊酯原藥為97000～98000元、毒死蜱原藥為 34000～35000元。據統計，大宗常規農藥品種中價格上揚的品種占70%～80%。農藥產品生產進入高成本階段有三大因素：
一是原材料價格上漲，農藥生產企業成本飛快增加。原料價格上漲是促使農藥品種漲價的首要因素，農藥產品價格隨著上游原材料的漲跌而波動。由于有機溶劑大幅漲價，有機磷農藥的基礎原料黃磷價格也穩中有升，迫使有機磷產品毒死蜱、敵敵畏、丙溴磷等都有10%以上的漲幅。烯啶蟲胺重要原料乙腈2009年開始出現供需缺口，價格從低谷時的2萬～3萬元漲到12萬元；2010年仍維持在高價位，烯啶蟲胺主流生產企業95%原藥的價格已達42萬元。如果乙腈價格居高不下，烯啶蟲胺原藥價格還會有一定的漲幅。草甘膦的成本也在快速上升，其主要原料多聚甲醛一路走高。同時天然氣價格大幅提高，使以天然氣為原料的甘氨酸和亞氨基二乙腈的生產成本上升。另外國際原油價格上漲，導致IDA法生產草甘膦的主要原料二乙醇氨成本上升。
二是環境綜合治理成本提高和節能減排的實施增加了企業的成本。農藥行業既是POPs涉及面最廣的行業，也是國內環境污染重點監控的行業，減排要求高。由于國家加大了環保治理力度，農藥企業增加了對環保設施的投入，“三廢”治理費用增加，使農藥的生產成本明顯上升。如草甘膦出廠價格目前為24500元，而僅處理高濃度廢液每生產1噸草甘膦就需5000元左右，如加上其他“三廢”處理費，每噸草甘膦環保成本在1萬元左右。國內目前有2600多家農藥生產企業，平均環保投資占總投資的4.86%，而歐美發達國家農藥項目的環保投資約占總投資的30%～40%。節能減排成了我國農藥生產企業生存的決定因素。
三是國外農藥登記和解決貿易摩擦成本增加。為了釋放龐大的產能，我國農藥企業對外依存度較大。為了使農藥出口利潤的重頭不被“貼牌出口”的外國公司攝取，不少企業不惜花費重金到國外進行產品登記。在非洲登記的費用大約2萬美元左右，在俄羅斯登記一個品牌的費用大約需要10萬美元，到歐盟和美國登記的費用更加昂貴。由于我國農藥的出口量增長迅速，而且價格低廉，致使澳大利亞、巴西、阿根廷、歐盟和美國等國家都對我國的農藥產品實施了反傾銷調查。近年來我國不少企業為解決不斷增多的農藥出口遭遇的貿易摩擦，花費不少金額打國際官司，平息反傾銷調查。
