由于復混肥配比較多，加上有些生產企業所處位置距消費市場較遠，需要遠距離運輸，因此，一些知名企業會選擇在市場地尋求企業代工，大家常說“貼牌生產”，還有一部分就是當地經銷商為了區別其他產品，尋找代工。雖然雙方也簽訂質量保證協議，多數說明出現質量問題，由誰承擔，但卻沒有提到是農民損失該如何解決。因此一些代工化肥銷售還不錯，但卻對知名企業的品牌存在著很大隱患。
因為如果代工化肥不合格，農民朋友產生損失。隨著農民朋友辨別能力增強，他們必然會像質疑月餅問題一樣質疑化肥質量，從而對那些知名品牌產生懷疑。因此尋求代工的化肥企業，不但要注意自身的品牌價值，更要注意選擇經得住考驗，被農民認可，質量有保證的企業來代工。切不可為了降低成本，尋找不知名小企業代工，可謂是損人不利己。
我國化肥消費區域性特征明顯，如果大型企業想拓展市場，不妨與各地的知名企業建立聯盟，大家互相代工，以等價產品交換的方式合作，這樣既可以省下很大的運輸成本，在質量上也有保證。對于經銷企業尋求代工企業也盡量選擇生產穩定，信譽良好的企業合作。合作雙方一定不能只限定出了問題，誰來解決，而更重要的是選擇不出問題的合作伙伴。同時希望國家對代工現象制定相關條款，維護市場秩序，保證產品質量，保證市場需求。
