生物肥料：研發模式仍較為傳統
生物肥料在我國開發利用較早，其在改善作物品質、降低成本、提高產量、減少環境污染、改善土壤性質方面具有重要作用。
通過多年的研究積累，我國在固氮、分解土壤有機物質和難溶性礦物、抗病與刺激作物生長、根系共生菌等領域相繼開發出微生物土壤接種劑、肥田靈復合生物肥、微生物葉面增效劑、解磷、溶磷、解鉀、促生磷、聯合固氮細菌等一批生物肥料產品。
我國近年生物肥料專利增加較快，個別生物肥料企業已經或即將進入其他國家市場。據統計，截至2011年8月，獲得農業部正式登記的微生物肥料品種有621種，臨時登記的品種有648種。現有生物肥料企業500余家，年產量450萬噸、應用面積666.7萬公頃、產值80億元，在生產中發揮了較大作用。
但是由于我國人口基數大，當前農業追求單位面積產量，過度使用化肥，化肥利用率呈逐年下降趨勢。其中我國氮肥平均施用量將近是美國的3倍，化肥的過度施用造成了土壤結構破壞、自然界生物多樣性和生態系統穩定性降低、江河湖泊的富營養化、農產品質量下降等一系列較為嚴重的問題。
同時，我國生物肥料的研究開發模式仍較為傳統，以大學、科研單位作為創新主體完成的技術與產品研發無法快速、有效地轉化為企業的產品；我國現有的生物肥料生產企業多數規模較小，設備工藝不足，還沒有成為生物肥料的創新主體。
國家雖然在生物肥料方面實行登記管理制度，但管理力度和有關政策有待完善；生物肥料的宣傳、生產和銷售還沒有很好地結合在一起，農業經營者在生物肥料上的認識還不夠，其銷售比例在全國肥料中比重偏低。
生物農藥：企業規模及創新力待加強
中國生物農藥的研究自建國初期即開始了Bt殺蟲劑的研究，經過幾十年的自主原始創新和發展，已相繼開發出了200多種具有自主知識產權和中國特色的生物農藥產品，部分產品和技術已經通過合作等方式輸出到國際市場。
其中一些產品開發已經形成了一定規模，如井岡霉素、赤霉素、阿維菌素和Bt四個品種的年產值均超億元。我國成為井岡霉素、赤霉素、阿維菌素的最大生產國。
近幾年來，我國在生物農藥菌種引進、資源篩選評價、新產品開發、生產工藝、產品質量檢測及工業化生產等方面都取得了一定的發展，登記的生物農藥活性成分品種達到140多種，年產量12~13萬噸制劑，生物農藥在農藥總量中占有量約為12%。每年新研制成功和登記注冊的生物農藥品種仍在不斷遞增。
但由于國家支持力度不夠，生物農藥產業在我國沒有得到足夠的重視，企業規模及創新實力亟待加強，生物農藥產品本身存在一定缺陷，產品宣傳推廣力度不夠等制約了生物農藥的快速普及和全面推廣。
目前，我國農藥生產企業有2200多家，其中生物農藥生產企業約260家，還在維持生產的僅有100家左右，年產值超億元的僅4家上市公司。當前生物農藥年產值僅為10~20億元，平均每個等級品種的年產值僅為200多萬元，而井岡霉素、阿維菌素等市場規模已占到生物農藥行業的90%左右，充分說明其市場產品單一，產業化規模和研究深度不夠。在生產規模、價格優勢、供應量等方面均無法滿足國內外市場的需求，仍需不斷加強。
