鐵路運輸不同政策
按照我國對化肥行業的相關政策，我國化肥鐵路運輸享受的一定的優惠政策，同時整車化肥免征鐵路建設基金，而至目前有機肥卻不能享受這樣的政策。
根據國家相關鐵路運輸規定，享受國家優惠運價的化肥有硫酸銨、尿素、氯化銨、碳酸氫銨、氰銨化鈣、過磷酸鈣、重過磷酸鈣、鈣鎂磷肥、肥料級磷酸氫鈣、氯化鉀、硫酸鉀、磷酸銨（磷酸一銨、磷酸二銨）、硝基磷酸銨、硝酸磷肥、磷酸二氫鉀、硝酸鉀、硝酸銨鈣、鈣鎂磷鉀肥、復混肥料（復合肥料）。復混肥料（復合肥料）是指符合國家標準（GB15063—2001）以氮、磷、鉀為基礎養分的三元或者二元固體肥料，但不含有有機—無機復混肥料（執行鐵路2號運價）。
執行國家2號運價的肥料為有機肥料及其他肥料，即含農家肥料、有機—無機復混肥料等有機肥料。
對于化肥與有機肥在鐵路運輸方面的差別，主要就體現在鐵路運輸費用與鐵路建設基金費用上。
目前國家鐵路運輸費用的計算方式為：整車貨物每噸運價=基價1+基價2 ×運價公里。（參照圖表一）
按照國家2008年新調整的鐵路的運價規定：化肥運輸仍然執行的是優惠運價，即整車農業化肥基價1為4.40元/噸，基價2為0.0305元/噸公里，如果按照一個車皮（60噸）運行1000公里計算，化肥鐵路運輸費用為4.4×60+0.0305×60×1000=2094；
有機肥執行的是國家2號運價，運輸基價1為6.40元/噸，基價2為0.0378元/噸，有機肥鐵路運輸費用為6.4×60+0.0378×60×1000=2652。
相比之下，有機肥料較化肥基價1相差2元/噸，基價2相差0.0073元/噸，如果按照一個車皮（60噸）運行1000公里計算，則相差2×60+0.0073×60×1000=558元，即有機肥運輸費用要比化肥運輸費用高出558元/噸左右。
同時，與無機肥相比，有機肥還承擔著鐵路建設基金費用，而對于有機肥來說，鐵路建設基金是貨物運輸中最大的一筆支出。根據鐵道部相關文件規定，國營的正式營業線和實行統一運價的運營臨管線按“鐵路建設基金費率表”規定的費率核收鐵路建設基金。計算公式為：建設基金=費率×計費重量×運價里程。（參照圖表二）
按照1噸重量計算，每1000公里要繳納鐵路建設基金費用為19.8（0.0198×1×1000=19.8）元；按照一個車皮（60噸）計算，每1000公里要繳納鐵路建設基金費用則為（1.122×1000=1122）1122元。
如此，按照一個車皮1000公里運程，目前僅鐵路運費及鐵路建設基金費用兩項，有機肥鐵路運輸總計費用為3774元，即每1個車皮運行1000公里，有機肥比化肥承擔運費就要高出（558+1122=1680）1680元左右，有機肥的鐵路運輸費用比化肥的鐵路運輸費用要高出80%左右。再加上鐵路電氣化附加費、新路新價均攤運費、集裝箱運價政策等多種費用形式，有機肥的運輸費用約高于化肥100％左右，即有機肥鐵路運輸費用幾乎是化肥鐵路運輸的一倍。
市場呼喚“同等待遇”
當初為解決人口溫飽問題，國家在政策出臺了化肥的支農政策，鐵路運輸要優先保證化肥的有效運輸，由于有機肥商品化發展滯后，在當時鐵路運輸中沒有將有機肥納入優惠運價范圍。近些年，在國家政策號召下，我國商品有機肥發展已邁開了產業化步伐，但是卻沒有相配套的產業扶持政策。德州大自然肥業有限公司總經理陳士華認為，國家政策提倡使用有機肥，提高土壤肥力，同樣是服務于農業生產，出于公平對待的原則，在有機肥生產和運輸上，應該與化肥享受“同等待遇”。
陳士華的建議代表著絕大多數有機肥企業的心聲，而隨著有機肥行業產業化發展的進步與市場形勢的變化，有機肥生產低成本與運輸高成本之間的矛盾也漸現突出，據了解，不足1000元的有機肥產品，運費往往就占去了1/5。尤其是企業規模大、產品銷售網絡廣的企業，在產品流通受到鐵路運費的影響就越大，有機肥企業對此反響強烈。
山東泉林嘉有肥料有限公司是我國目前產業化發展較高的有機肥企業之一，目前年產各類綠色有機肥40萬噸。其利用秸稈為原料生產的綠色有機肥，其產品性能得到了市場的充分認可，并銷往全國各地，然而其運輸費用卻成為企業發展的沉重的壓力。據企業介紹，其山東德州到新疆吐魯番，一般化肥運費（包括鐵路運輸以及短途運輸），約在160元/噸左右，而有機肥及有機無機復合肥運費大約在350元/噸左右。路途越遠，費用越高，按照企業產品到達全國市場的平均運費計算，有機肥鐵路運輸較化肥鐵路運輸平均高出100元/噸左右，按照企業年產40萬噸產能計算，總計多出運費4000萬元左右。
梅花生物科技集團有限公司營銷公司綠農生化副總經理燕汝順認為，雖然將來國家可能會將鐵路、運輸等對肥料方面的優惠全部取消，但是從現在來看，尿素、一銨、二銨、復合肥等全部享受優惠運價，但是有機肥還享受不到。如果有機肥在運費上每噸能夠便宜5元錢，反過來給農戶回饋的話，不僅為農民節省很多錢，同時也可以使有機肥獲得很好的推廣動力。
而更多業內人士則提出，鐵路運費的“不同等待遇”不利于企業的市場中發揮競爭優勢和公平競爭，成為制約企業產業化發展的重要因素。目前，無論是從政策導向還是市場需求看，我國有機肥行業迎來大好發展機遇，有機肥有望進入主流農資銷售渠道，市場需要重新梳理，產業政策需要更加明晰，企業對此寄予了更多的期待。
