（一）化肥生產企業成本持高不下。無煙煤是化肥生產的主要原材料，但占化肥生產成本70%的原材料無煙煤價格卻居高不下。河南只有焦作有少量無煙煤，不能滿足河南市場需求，一部分無煙煤是從山西省購進。最近由于山西礦難和山西政策性治理整頓30萬噸以下小型煤礦，更助推了無煙煤價格的堅挺不下。即使在2008年下半年煤炭價格下跌、市場疲軟的情況下，山西無煙煤購進價格仍居高不下。平頂山某化肥生產企業反映，該企業從山西購進的無煙煤，從2008年1月份起至10月份呈逐月上漲態勢，由1月份的746.01元/噸飆升至10月份的1105.81元/噸。
（二）化肥生產企業用電用氣優惠力度不夠。據化肥企業負責人反映，國家對于化肥企業用電用氣有一定的優惠政策，但是力度不夠，效果一般。如對于企業用電，雖然國家和當地政府給予企業一定的優惠，但是在用電的高谷峰時期，優惠政策落實有差別。高峰時期優惠較少，谷底時期優惠較多，實際上企業的用電成本并沒有降低。
（三）化肥企業融資困難。據企業反映，銀行處于自身利益考慮，企業不缺資金時，銀行主動上門“錦上添花”，企業急需資金時，銀行并沒有“雪中送炭”，致使企業常常因為資金困難不能正常生產。
（四）外運火車皮緊張。據調查，部分化肥生產企業產品外運所需車皮緊張。一是計劃審批難，需要多方多次協調才能解決，影響企業正常生產；二是貨運管理不規范，裝載貨物時不按車皮標定重量裝載，收費卻按車皮標重收費。如標重為60噸的車皮只允許裝載50噸的貨物，收費則按60噸車皮標重收取，企業為了及時出貨，只能聽之任之，增加了企業的銷售成本。據有些企業反映，目前外運車皮并不是非常緊張，只有外運農資產品的車皮稍有緊張，原因是農資貨物運費低，鐵路方面不愿意多發車皮運輸，導致了有的化肥生產企業不能按時發貨，影響了企業正常的生產經營、銷售和企業的信譽。
（五）化肥市場魚目混珠。一是化肥生產企業準入門檻太低。近幾年，化肥生產企業中涌現了許多企業規模小、技術水平低、生產能力弱、資金短缺的小型復合肥生產企業。這些企業的整體競爭能力較差，在市場競爭中處于弱勢；二是化肥市場假冒偽劣產品泛濫。這些產品大部分外包裝標示和內裝量不一致，標準含量低、質量差，因其價格低廉受到農民的青睞。據了解，復合肥中某種元素含量減少一個點，隨之就可降低成本70至80元，若氮、磷、鉀都減少一個點，一噸化肥就可降低成本240元。這些產品的存在對那些標準高、含量高、成本高的大型化肥生產企業銷售市場構成了很大沖擊。
